В годы Великой Отечественной войны предприятия Сходни выполняли заказы оборонного значения, население участвовало в строительстве оборонительных рубежей на территории Химкинского района.
В Сходне в июле 1941 г. в старом здании школы № 1 был сформирован химкинский батальон народного ополчения (520 чел.), вошедший в 4-ю дивизию народного ополчения Москвы, которой за доблесть и геройство в годы Великой Отечественной войны было присвоено звание 84-й гвардейской Карачевской Краснознаменной ордена Суворова стрелковой дивизии (на здании установлена мемориальная доска).
В конце ноября и начале декабря 1941 г. шли ожесточенные бои на Крюковско-Сходненском направлении. Недалеко от Сходни, в д. Коростово, находился штаб 16-й армии генерала К. К. Рокоссовского. Все попытки врага прорваться к Сходне окончились провалом.
В Сходне сооружен памятник «Скорбящая мать»» на братской могиле советских воинов, погибших в боях за Москву. В д. Пекино силами сходненцев установлен обелиск «Павшим в боях за Москву».
После разгрома врага под Москвой началось восстановление ст. Сходня и разрушенного полотна Октябрьской железной дороги.
В 1942 г. в поселке была открыта артель инвалидов им. Великой Отечественной войны. На зеркальной фабрике валяли валенки, шили и ремонтировали кожаную обувь для Советской Армии и населения. Мебельная артель «Возрождение» выпускала пулеметные лыжи, ящики для гранат.